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Investigación
Líneas de investigación
Contenidos con Investigacion .
Subunidad de Bioinformática y Gestión de Datos
Esta subunidad (Bioinformática y Gestión de Datos (BIOGEDA), Bioinformatics and Data Management (BIODAMA)), integrada en la Unidad de Epidemiología del Cáncer y Ambiental, tiene como principales líneas de investigación:
- Diseño y desarrollo de instrumentos para la obtención de información y transmisión de la misma en la investigación epidemiológica.
- Integración de fuentes de información y datos epidemiológicos
- Bioinformática en el contexto de la epidemiología molecular/genética.
- Infraestructuras de computación, almacenaje y transferencia de datos en salud.
Publicaciones destacadas
Detection of spatial aggregation of cases of cáncer from data on patients and health centres contained in the Minimum Basic Data Set
Fernandez-Navarro, Pablo; et al. 2Detection of spatial aggregation of cases of cáncer from data on patients and health centres contained in the Minimum Basic Data Set GEOSPATIAL HEALTH. UNIV NAPLES FEDERICO II. 13-1, pp.86-92
PUBMED DOIPatterns of Differentially Expressed circRNAs in Human Thymocytes.
Patterns of Differentially Expressed circRNAs in Human Thymocytes. López-Nieva P, Fernández-Navarro P, Cobos-Fernández MÁ, González-Vasconcellos I, Sánchez Pérez R, Aroca Á, Fernández-Piqueras J, Santos J. Noncoding RNA. 2022 Mar 30;8(2):26. doi: 10.3390/ncrna8020026. PMID: 35447889 Free PMC article.
PUBMED DOIAssociation between heavy metal and metalloid levels in topsoil and cancer mortality in Spain
Núñez, O.; et al. 2017. Association between heavy metal and metalloid levels in topsoil and cancer mortality in Spain.Environmental science and pollution research international. 24-8, pp.7413-7421. ISSN 1614-7499.
PUBMED DOIUser profiles of an electronic mental health tool for ecological momentary assessment: MEmind
Barrigón, ML.; et al. 2017. User profiles of an electronic mental health tool for ecological momentary assessment: MEmind.International journal of methods in psychiatric research. 26-1. ISSN 1557-0657.
PUBMED DOISOCS3 deregulation contributes to aberrant activation of the JAK/STAT pathway in precursor T-cell neoplasms.
SOCS3 deregulation contributes to aberrant activation of the JAK/STAT pathway in precursor T-cell neoplasms. Lahera A, López-Nieva P, Alarcón H, Marín-Rubio JL, Cobos-Fernández MÁ, Fernández-Navarro P, Fernández AF, Vela-Martín L, Sastre I, Ruiz-García S, Llamas P, López-Lorenzo JL, Cornago J, Santos J, Fernández-Piqueras J, Villa-Morales M. Br J Haematol. 2023 May;201(4):718-724. doi: 10.1111/bjh.18694. Epub 2023 Feb 14. PMID: 36786170
PUBMED DOIRural-urban gradients and all-cause, cardiovascular and cancer mortality in Spain using individual data.
Rural-urban gradients and all-cause, cardiovascular and cancer mortality in Spain using individual data. Ayuso-Álvarez A, Ortiz C, López-Cuadrado T, Rodríguez-Blázquez C, Fernández-Navarro P, González-Palacios J, Damián J, Galán I. SSM Popul Health. 2022 Sep 19;19:101232. doi: 10.1016/j.ssmph.2022.101232. eCollection 2022 Sep. PMID: 36188419 Free PMC article.
PUBMED DOIRNA-Seq reveals the existence of a CDKN1C-E2F1-TP53 axis that is altered in human T-cell lymphoblastic lymphomas BMC CANCER
Lopez-Nieva, Pilar; et al. 2018. RNA-Seq reveals the existence of a CDKN1C-E2F1-TP53 axis that is altered in human T-cell lymphoblastic lymphomas BMC CANCER. BMC. 18. ISSN 1471-2407.
PUBMED DOIContenidos con Investigacion .
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Pablo Fernández-Navarro
Investigador científico
Código ORCID: 0000-0001-9427-2581
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Celia Talaván González
Titulada Superior (Ing. Biomédica)
Código ORCID: 0009-0006-2788-125X
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Mario González Sánchez
Técnico Superior (Bioinformático)
Código ORCID: 0000-0003-0229-3559
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Javier González Palacios
Técnico Superior (Bioinformático)
Código ORCID: 0000-0002-8099-8469
Listado de personal
Información adicional
Los objetivos principales de esta subunidad son:
- Prestar apoyo en diseño y gestión de bases de datos y aplicaciones para dispositivos móviles/aplicaciones web
- Mantener los servidores de información de enfermedades crónicas y de mortalidad con los que cuenta el CNE (Servidor de Información Epidemiológica on-line “ARIADNA” (https://ariadna.isciii.es/), Servidor de Información Epidemiológica on-line “RAZIEL” (https://raziel.isciii.es/).
- Dar soporte técnico y logístico a la investigación en enfermedades crónicas desde un punto de vista genético y bioinformático (Gestión y desarrollo de aplicaciones de anotación para marcadores genéticos (SNPs, MicroRNA, etc) y extracción de información de estos, Tools de recodificación de identificadores de marcadores y cruces de bases de datos genómicas y representación de datos genómicos).
- Investigar y desarrollar métodos relacionados con instrumentos para la obtención de información y transmisión de esta en la investigación epidemiológica, la integración de fuentes de información y datos epidemiológicos y las infraestructuras de computación, almacenaje y transferencia de datos en salud.
Contacto
Tel.: +34 91 822 26 44
Email: pfernandezn@isciii.es