Protegemos tu salud a través de la Ciencia
Investigación
Líneas de investigación
Contenidos con Investigacion .
Subunidad de Bioinformática y Gestión de Datos
Esta subunidad (Bioinformática y Gestión de Datos (BIOGEDA), Bioinformatics and Data Management (BIODAMA)), integrada en la Unidad de Epidemiología del Cáncer y Ambiental, tiene como principales líneas de investigación:
- Diseño y desarrollo de instrumentos para la obtención de información y transmisión de la misma en la investigación epidemiológica.
- Integración de fuentes de información y datos epidemiológicos
- Bioinformática en el contexto de la epidemiología molecular/genética.
- Infraestructuras de computación, almacenaje y transferencia de datos en salud.
Publicaciones destacadas
Nonmotor symptoms evolution during 24 months of bilateral subthalamic stimulation in Parkinson's disease
1. Dafsari HS, Silverdale M, Strack M, Rizos A, Ashkan K, Mahlstedt P, Sachse L, Steffen J, Dembek TA, Visser-Vandewalle V, Evans J, Antonini A, Martinez-Martin P, Ray-Chaudhuri K, Timmermann L. Nonmotor symptoms evolution during 24 months of bilateral subthalamic stimulation in Parkinson's disease. Mov Disord 2018;33(3):421-30. [doi].PM:29465787. FI: 8,324; Q1
DOIRisk of transmission of sporadic Creutzfeldt-Jakob disease by surgical procedures: systematic reviews and quality of evidence
2. García López FJ, Ruiz-Tovar M, Almazán-Isla J, Alcalde-Cabero E, Calero M, de Pedro-Cuesta J. Risk of transmission of sporadic Creutzfeldt-Jakob disease by surgical procedures: systematic reviews and quality of evidence. Euro Surveill 2017;22(43). [doi].PM:29090678. FI: 7,127; Q1
DOIValidation study of the hoehn and yahr scale included in the MDS-UPDRS
3. Martinez-Martin P, Skorvanek M, Rojo-Abuin JM, Gregova Z, Stebbins GT, Goetz CG. Validation study of the hoehn and yahr scale included in the MDS-UPDRS. Mov Disord 2018;33(4):651-2. [doi].PM:29322548. FI: 8,324; Q1
DOIThe long-term direct and indirect economic burden among Parkinson's disease caregivers in the United States
4. Martinez-Martin P, Macaulay D, Jalundhwala YJ, Mu F, Ohashi E, Marshall T, Sail K. The long-term direct and indirect economic burden among Parkinson's disease caregivers in the United States. Mov Disord 2018. [doi].PM:30589953. FI: 8,324; Q1
DOIRelationship of Nocturnal Sleep Dysfunction and Pain Subtypes in Parkinson's Disease
5. Martinez-Martin P, Rizos AM, Wetmore JB, Antonini A, Odin P, Pal S, Sophia R, Carroll C, Martino D, Falup-Pecurariu C, Kessel B, Andrews T, Paviour D, Trenkwalder C, Chaudhuri KR. Relationship of Nocturnal Sleep Dysfunction and Pain Subtypes in Parkinson's Disease. Mov Disord Clin Pract 2019;6(1):57-64. doi: 10.1002/mdc3.12694;doi: 10.1002/mdc3.12694.. FI: 8,324; Q1
DOIRating Scales and Performance-based Measures for Assessment of Functional Ability in Huntington's Disease: Critique and Recommendations
6. Mestre TA, Busse M, Davis AM, Quinn L, Rodrigues FB, Burgunder JM, Carlozzi NE, Walker F, Ho AK, Sampaio C, Goetz CG, Cubo E, Martinez-Martin P, Stebbins GT. Rating Scales and Performance-based Measures for Assessment of Functional Ability in Huntington's Disease: Critique and Recommendations. Mov Disord Clin Pract 2018;5(4):361-72. [doi];MDC312617 [pii].PM:30363510. FI: 8,324; Q1
DOIRating scales for cognition in Huntington's disease: Critique and recommendations
7. Mestre TA, Bachoud-Levi AC, Marinus J, Stout JC, Paulsen JS, Como P, Duff K, Sampaio C, Goetz CG, Cubo E, Stebbins GT, Martinez-Martin P. Rating scales for cognition in Huntington's disease: Critique and recommendations. Mov Disord 2018;33(2):187-95. [doi].PM:29278291. FI: 8,324; Q1
DOIThe Neuropsychiatric Fluctuations Scale for Parkinson's Disease: A Pilot Study
8. Schmitt E, Krack P, Castrioto A, Klinger H, Bichon A, Lhommee E, Pelissier P, Fraix V, Thobois S, Moro E, Martinez-Martin P. The Neuropsychiatric Fluctuations Scale for Parkinson's Disease: A Pilot Study. Mov Disord Clin Pract 2018;5(3):265-72. [doi];MDC312607 [pii].PM:30363450. FI: 8,324; Q1
DOIGlobal scales for cognitive screening in Parkinson's disease: Critique and recommendations
9. Skorvanek M, Goldman JG, Jahanshahi M, Marras C, Rektorova I, Schmand B, van DE, Goetz CG, Weintraub D, Stebbins GT, Martinez-Martin P. Global scales for cognitive screening in Parkinson's disease: Critique and recommendations. Mov Disord 2018;33(2):208-18. [doi].PM:29168899. FI: 8,324; Q1
DOIReply: MoCA for cognitive screening in Parkinson's disease: Beware of floor effect
10. Skorvanek M, Goldman JG, Jahanshahi M, Marras C, Rektorova I, Schmand B, van DE, Goetz CG, Weintraub D, Stebbins GT, Martinez-Martin P. Reply: MoCA for cognitive screening in Parkinson's disease: Beware of floor effect. Mov Disord 2018;33(3):499-500. [doi].PM:29460975. FI: 8,324; Q1
Detection of spatial aggregation of cases of cáncer from data on patients and health centres contained in the Minimum Basic Data Set
Fernandez-Navarro, Pablo; et al. 2Detection of spatial aggregation of cases of cáncer from data on patients and health centres contained in the Minimum Basic Data Set GEOSPATIAL HEALTH. UNIV NAPLES FEDERICO II. 13-1, pp.86-92
PUBMED DOIPatterns of Differentially Expressed circRNAs in Human Thymocytes.
Patterns of Differentially Expressed circRNAs in Human Thymocytes. López-Nieva P, Fernández-Navarro P, Cobos-Fernández MÁ, González-Vasconcellos I, Sánchez Pérez R, Aroca Á, Fernández-Piqueras J, Santos J. Noncoding RNA. 2022 Mar 30;8(2):26. doi: 10.3390/ncrna8020026. PMID: 35447889 Free PMC article.
PUBMED DOIAssociation between heavy metal and metalloid levels in topsoil and cancer mortality in Spain
Núñez, O.; et al. 2017. Association between heavy metal and metalloid levels in topsoil and cancer mortality in Spain.Environmental science and pollution research international. 24-8, pp.7413-7421. ISSN 1614-7499.
PUBMED DOIUser profiles of an electronic mental health tool for ecological momentary assessment: MEmind
Barrigón, ML.; et al. 2017. User profiles of an electronic mental health tool for ecological momentary assessment: MEmind.International journal of methods in psychiatric research. 26-1. ISSN 1557-0657.
PUBMED DOISOCS3 deregulation contributes to aberrant activation of the JAK/STAT pathway in precursor T-cell neoplasms.
SOCS3 deregulation contributes to aberrant activation of the JAK/STAT pathway in precursor T-cell neoplasms. Lahera A, López-Nieva P, Alarcón H, Marín-Rubio JL, Cobos-Fernández MÁ, Fernández-Navarro P, Fernández AF, Vela-Martín L, Sastre I, Ruiz-García S, Llamas P, López-Lorenzo JL, Cornago J, Santos J, Fernández-Piqueras J, Villa-Morales M. Br J Haematol. 2023 May;201(4):718-724. doi: 10.1111/bjh.18694. Epub 2023 Feb 14. PMID: 36786170
PUBMED DOIRural-urban gradients and all-cause, cardiovascular and cancer mortality in Spain using individual data.
Rural-urban gradients and all-cause, cardiovascular and cancer mortality in Spain using individual data. Ayuso-Álvarez A, Ortiz C, López-Cuadrado T, Rodríguez-Blázquez C, Fernández-Navarro P, González-Palacios J, Damián J, Galán I. SSM Popul Health. 2022 Sep 19;19:101232. doi: 10.1016/j.ssmph.2022.101232. eCollection 2022 Sep. PMID: 36188419 Free PMC article.
PUBMED DOIInformación adicional
Los objetivos principales de esta subunidad son:
- Prestar apoyo en diseño y gestión de bases de datos y aplicaciones para dispositivos móviles/aplicaciones web
- Mantener los servidores de información de enfermedades crónicas y de mortalidad con los que cuenta el CNE (Servidor de Información Epidemiológica on-line “ARIADNA” (https://ariadna.isciii.es/), Servidor de Información Epidemiológica on-line “RAZIEL” (https://raziel.isciii.es/).
- Dar soporte técnico y logístico a la investigación en enfermedades crónicas desde un punto de vista genético y bioinformático (Gestión y desarrollo de aplicaciones de anotación para marcadores genéticos (SNPs, MicroRNA, etc) y extracción de información de estos, Tools de recodificación de identificadores de marcadores y cruces de bases de datos genómicas y representación de datos genómicos).
- Investigar y desarrollar métodos relacionados con instrumentos para la obtención de información y transmisión de esta en la investigación epidemiológica, la integración de fuentes de información y datos epidemiológicos y las infraestructuras de computación, almacenaje y transferencia de datos en salud.
Contacto
Tel.: +34 91 822 26 44
Email: pfernandezn@isciii.es