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Subunidad de Bioinformática y Gestión de Datos
Esta subunidad (Bioinformática y Gestión de Datos (BIOGEDA), Bioinformatics and Data Management (BIODAMA)), integrada en la Unidad de Epidemiología del Cáncer y Ambiental, tiene como principales líneas de investigación:
- Diseño y desarrollo de instrumentos para la obtención de información y transmisión de la misma en la investigación epidemiológica.
- Integración de fuentes de información y datos epidemiológicos
- Bioinformática en el contexto de la epidemiología molecular/genética.
- Infraestructuras de computación, almacenaje y transferencia de datos en salud.
Publicaciones destacadas
Effectiveness and tolerability of dolutegravir and abacavir/lamivudine administered as two separate pills compared to their equivalent single-tablet regimen in a multicentre cohort in Spain.
Suárez-García I, Alejos B, Ruiz-Algueró M, García Yubero C, Moreno C, Bernal E, Pérez-Is L, Zubero Z, de Zárraga Fernández MA, Samperiz Abad G, Jarrín I; Cohort of the Spanish HIV/AIDS Research Network (CoRIS). J Int AIDS Soc. 2021 Jul;24(7):e25758.
PUBMEDUtility of MF-non coding region for measles molecular surveillance during post-elimination phase, Spain, 2017-2020.
Jacqueline C, Gavilán AM, López-Perea N, Penedos AR, Masa-Calles J, Echevarría JE, Fernández-García A; MMR Study Group. Front Microbiol. 2023 May 22;14:1143933.
DOIVaccine effectiveness against influenza hospitalisation in adults during the 2022/2023 mixed season of influenza A(H1N1)pdm09, A(H3N2) and B circulation, Europe: VEBIS SARI VE hospital network.
Rose AMC, Pozo F, Martínez-Baz I, Mazagatos C, Bossuyt N, Cauchi JP, et al. Influenza Other Respir Viruses. 2024 Feb;18(2):e13255.
PUBMED DOIIncidence and severity of COVID-19 in HIV-positive persons receiving antiretroviral therapy: a cohort study.
Del Amo J, Polo R, Moreno S, Díaz A, Martínez E, Arribas JR, Jarrín I, Hernán MA; The Spanish HIV/COVID-19 Collaboration. Ann Intern Med 2020; 173(7): 536-541
PUBMEDVigilancia epidemiológica y virológica de la parotiditis en España, 2005-2022.
Horcas de Frutos A, López-Perea N, Fernández-García A, Gavilán AM, Echevarría JE, Olivares-Quintanar D, et al. BES [Internet]. 29 de septiembre de 2023, 31(3):139-65.
DOISocial and behavioural determinants of syphilis: Modelling based on repeated cross-sectional surveys from 2010 and 2017 among 278,256 men who have sex with men in 31 European countries.
Mendez-Lopez A, Stuckler D, Marcus U, Hickson F, Noori T, Whittaker RN, Jansen K, Diaz A, Henszel L, Velter A, Semenza JC, Schmidt AJ. Lancet Reg Health Eur. 2022; 22:100483.
PUBMED DOIEffectiveness and safety of first-line antiretroviral regimens in clinical practice: a multicentre cohort study.
Alejos B, Suárez-García I, Rava M, Bautista-Hernández A, Gutierrez F, Dalmau D, Sagastagoitia I, Rivero A, Moreno S, Jarrín I; CoRIS. J Antimicrob Chemother. 2020 Oct 1;75(10):3004-3014.
PUBMEDAn interregional measles outbreak in Spain with nosocomial transmission, November 2017 to July 2018.
Pampaka Despina, López-Perea Noemí, Fernández-García Aurora, Huertas-Zarco Isabel, Castellanos-Martínez Maite, Villatoro-Bongiorno Katja, Roig-Sena Javier, Torner Nuria, Mar Mosquera María, Echevarría Juan Emilio, Prats Joaquim Ferras, Masa-Calles Josefa. Euro Surveill. 2023;28(17):pii=2200634.
DOIMonitoring progress towards elimination of hepatitis B and C in the EU/EEA.
Sharrock KC, Noori T, Axelsson M, Buti M, Diaz A, Fursa O, Hendrickx G, James C, Klavs I, Korenjak M, Maticic M, Mozalevskis A, Peters L, Rigoni R, Rosinska M, Ruutel K, Schatz E, Seyler T, Veldhuijzen I, Duffell E. PLOS Glob Public Health. 2022; 2(8): e0000841.
PUBMED DOIPhysicians’ opinions on generic antiretroviral drugs and single-tablet regimen de-simplification for the treatment of HIV infection: a multicentre survey in Spain.
Suárez-García I., Ruiz-Algueró M., García Yubero C., Moreno C., Belza MJ., Estébanez M., de Los Santos I., Masiá M., Samperiz Abad G., Muñoz Sánchez J., Omar M., Jarrín I.; Cohort of the Spanish HIV/AIDS Research Network (CoRIS). J Antimicrob Chemother. 2020 Feb 1;75(2):466-472.
PUBMEDEpidemiology of Herpes Zoster in the pre-vaccination era: establishing the baseline for vaccination programme’s impact in Spain.
Risco Risco Carlos, Herrador Zaida, López-Parea Noemi, Martinez-Urbistondo Diego, del Villar Carrero Rafael Suarez, Masa-Calles Josefa.Euro Surveill. 2023;28(8):pii=2200390.
DOIMeasles in Vaccinated People: Epidemiology and Challenges in Surveillance and Diagnosis in the Post-Elimination Phase. Spain, 2014–2020.
López-Perea, N.; Fernández-García, A.; Echevarría, J.E.; de Ory, F.; Pérez-Olmeda, M.; Masa-Calles, J. Viruses 2021, 13, 1982.
DOIInformación adicional
Los objetivos principales de esta subunidad son:
- Prestar apoyo en diseño y gestión de bases de datos y aplicaciones para dispositivos móviles/aplicaciones web
- Mantener los servidores de información de enfermedades crónicas y de mortalidad con los que cuenta el CNE (Servidor de Información Epidemiológica on-line “ARIADNA” (https://ariadna.isciii.es/), Servidor de Información Epidemiológica on-line “RAZIEL” (https://raziel.isciii.es/).
- Dar soporte técnico y logístico a la investigación en enfermedades crónicas desde un punto de vista genético y bioinformático (Gestión y desarrollo de aplicaciones de anotación para marcadores genéticos (SNPs, MicroRNA, etc) y extracción de información de estos, Tools de recodificación de identificadores de marcadores y cruces de bases de datos genómicas y representación de datos genómicos).
- Investigar y desarrollar métodos relacionados con instrumentos para la obtención de información y transmisión de esta en la investigación epidemiológica, la integración de fuentes de información y datos epidemiológicos y las infraestructuras de computación, almacenaje y transferencia de datos en salud.
Contacto
Tel.: +34 91 822 26 44
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