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Investigación
Líneas de investigación
Contenidos con Investigacion .
Subunidad de Bioinformática y Gestión de Datos
Esta subunidad (Bioinformática y Gestión de Datos (BIOGEDA), Bioinformatics and Data Management (BIODAMA)), integrada en la Unidad de Epidemiología del Cáncer y Ambiental, tiene como principales líneas de investigación:
- Diseño y desarrollo de instrumentos para la obtención de información y transmisión de la misma en la investigación epidemiológica.
- Integración de fuentes de información y datos epidemiológicos
- Bioinformática en el contexto de la epidemiología molecular/genética.
- Infraestructuras de computación, almacenaje y transferencia de datos en salud.
Publicaciones destacadas
RNA-Seq reveals the existence of a CDKN1C-E2F1-TP53 axis that is altered in human T-cell lymphoblastic lymphomas BMC CANCER
Lopez-Nieva, Pilar; et al. 2018. RNA-Seq reveals the existence of a CDKN1C-E2F1-TP53 axis that is altered in human T-cell lymphoblastic lymphomas BMC CANCER. BMC. 18. ISSN 1471-2407.
PUBMED DOIModeling the Regional Distribution of International Travelers in Spain to Estimate Imported Cases of Dengue and Malaria: Statistical Inference and Validation Study
David García-García, Beatriz Fernández-Martínez, Frederic Bartumeus, Diana Gómez-Barroso. JMIR Public Health Surveill . 2024 May 27:10:e51191.
PUBMED DOISituación epidemiológica prepandémica de la campilobacteriosis en España entre los años 2013-2019
Carbajo Otero A, Guerrero Vadillo M, León Gómez I, Varela Martínez MC. Situación epidemiológica prepandémica de la campilobacteriosis en España entre los años 2013-2019. Rev Salud ambient. 2023; 23(2):131-140.
First cross-border outbreak of foodborne botulism in the European Union associated with the consumption of commercial dried roach (Rutilus rutilus)
Hendrickx D, Varela Martínez C, Contzen M, Wagner-Wiening C, Janke K-H, Hernando Jiménez P, Massing S, Pichler J, Tichaczek-Dischinger P, Burckhardt F, Stark K, Katz K, Jurke A, Thole S, Carbó R, del Pobil Ferré MP, Nieto M, Zamora MJ, Sisó A, Pallares García P, Valdezate S, Schaade L, Worbs S, Dorner BG, Frank C and Dorner MB. First cross-border outbreak of foodborne botulism in the European Union associated with the consumption of commercial dried roach (Rutilus rutilus). Front. Public Health 2023;10:1039770.
PUBMED DOICaracterísticas epidemiológicas de los brotes de hepatitis A en España (años 2015-2019)
Guerrero-Vadillo M, Peñuelas Martínez M, Varela Martínez C. Características epidemiológicas de los brotes de hepatitis A en España (años 2015-2019). BES [Internet]. 24 de enero de 2022 ;29(2). Disponible en: //revista.isciii.es/index.php/bes/article/view/1124
Severity of the clinical presentation of hepatitis A in five European countries from 1995 to 2014
Severi E, Georgalis L, Pijnacker R, Veneti L, Turiac IA, Chiesa F, Rizzo C, Martinelli D, Vold L, Herrador BG, Martinez CV, Sanchez EVM, Semenza JC, Lopalco P, Dahlström LA, Giesecke J. Severity of the clinical presentation of hepatitis A in five European countries from 1995 to 2014. International Journal of Infectious Diseases 2022; 118, 34-43
PUBMED DOIInvestigation of an international outbreak of multidrug-resistant monophasic Salmonella Typhimurium associated with chocolate products, EU/EEA and United Kingdom, February to April 2022
Larkin L., de la Gandara M.P., Hoban A., Pulford C., Silva N.J.-D., de Valk H., Browning L., Falkenhorst G., Simon S., Lachmann R., Dryselius R., Karamehmedovic N., Börjesson S., van Cauteren D., Laisnez V., Mattheus W., Pijnacker R., van den Beld M., Mossong J., Ragimbeau C., Vergison A., Brandal L.T., Lange H., Garvey P., Nielsen C.S., León S.H., Varela C., Chattaway M., Weill F.-X., Brown D., McKeown P. Investigation of an international outbreak of multidrug-resistant monophasic Salmonella Typhimurium associated with chocolate products, EU/EEA and United Kingdom, February to April 2022. Euro Surveill2022;27(15):pii=2200314.
PUBMED DOIBotulism in Spain: Epidemiology and Outcomes of Antitoxin Treatment, 1997-2019
Peñuelas M, Guerrero-Vadillo M, Valdezate S, Zamora MJ, Leon-Gomez I, Flores-Cuéllar Á, Carrasco G, Díaz-García O, Varela C. Botulism in Spain: Epidemiology and Outcomes of Antitoxin Treatment, 1997-2019. Toxins (Basel). 2022 Dec 20;15(1):2.
PUBMED DOIPrevicet Working Group On Viral Hepatitis. Hepatitis A Outbreak Characteristics: A Comparison of Regions with Different Vaccination Strategies, Spain 2010-2018
Domínguez A, Varela C, Soldevila N, Izquierdo C, Guerrero M, Peñuelas M, Martínez A, Godoy P, Borràs E, Rius C, Torner N, Avellón AM, Castilla J, Previcet Working Group On Viral Hepatitis. Hepatitis A Outbreak Characteristics: A Comparison of Regions with Different Vaccination Strategies, Spain 2010-2018. Vaccines (Basel). 2021 Oct 20;9(11):1214.
PUBMED DOIStatement of Peer Review
Bygvraa, D.A.; Crespi, S.; Cornejo, M.D.; De Marez, L.; Hadjichristodoulou, C.; Harth, V.; Jelicic, P.; Klein, J.; Michaelakis, A.;Mouchtouri, V.; et al. Statement of Peer Review. Med. Sci. Forum 2023;13, 34.
DOIEvaluación de la sensibilidad del sistema de vigilancia del botulismo en España entre 1997 y 2019
Peñuelas M, Guerrero-Vadillo M, Díaz-García O, García-García D, Varela C. Evaluación de la sensibilidad del sistema de vigilancia del botulismo en España entre 1997 y 2019. BES [Internet]. 31 de marzo de 2023;31(1):37-43. Disponible en: //revista.isciii.es/index.php/bes/article/view/1285
Vigilancia epidemiológica de Shigelosis en España, 2016-2021
Guerrero-Vadillo M, Peñuelas M, Herrera León S, Suarez Rodriguez B, Díaz A, Guzmán Herrador B, et al. Vigilancia epidemiológica de Shigelosis en España, 2016-2021. BES [Internet]. 21 de marzo de 2022;29(8):90-8. Disponible en: //revista.isciii.es/index.php/bes/article/view/1201
Brotes de transmisión alimentaria. Red Nacional de Vigilancia Epidemiológica. 2012-2020
Chong A, Peñuelas M, Guerrero M, Cabezas C, Díaz O, Martín C, et al. Brotes de transmisión alimentaria. Red Nacional de Vigilancia Epidemiológica. 2012-2020. BES [Internet]. 29 de marzo de 2022;29(5):53-6. Disponible en: //revista.isciii.es/index.php/bes/article/view/1157
Hepatitis of unknown aetiology in children – epidemiological overview of cases reported in Europe, 1 January to 16 June 2022
Vidal A.R., Vaughan A., Innocenti F., Colombe S., Nerlander L., Rachwal N., Ciancio B.C., Mougkou A., Carvalho C., Delgado E., Mook P., De Muylder G., Peeters M., Tenev T., Golkocheva-Markova E., Jensen V.V.S., Koch A., Figoni J., Brouard C., Nikolopoulou G., Zisouli A., Murphy N., Broderick A., Goldberg L., Rich R., Sagie L.H., Tosti M.E., Suligoi B., Joosten R., Pijnacker R., Fjeldheim I., Heen E., Stȩpień M., Polański P., Marinho R.T., Martins J.V., Varela C., Avellón A., Andersson E., Mörk M.J., Mandal S., Watson C., Coughlan L., Chand M., Neill C., Bradley D.T., Li K., O'Leary M., McInnes N., Williams C.J., Moore C., Gjini A., Duffell E., Pebody R.. Hepatitis of unknown aetiology in children – epidemiological overview of cases reported in Europe, 1 January to 16 June 2022. Euro Surveill. 2022;27(31):pii=2200483.
PUBMED DOIEpidemiological Characteristics and Spatio-Temporal Distribution of Hepatitis A in Spain in the Context of the 2016/2017 European Outbreak
Guerrero-Vadillo M, Peñuelas M, Domínguez Á, Godoy P, Gómez-Barroso D, Soldevila N, Izquierdo C, Martínez A, Torner N, Avellón A, Rius C, Varela C. Epidemiological Characteristics and Spatio-Temporal Distribution of Hepatitis A in Spain in the Context of the 2016/2017 European Outbreak. Int J Environ Res Public Health. 2022 Dec 14;19(24):16775.
PUBMED DOIListeriosis outbreak caused by contaminated stuffed pork, Andalusia, Spain, July to October 2019
Fernández-Martínez N.F., Ruiz-Montero R., Briones E., Baños E., Rodríguez-Alarcón L.G.S.M., Chaves J.A., Abad R., Varela C., Lorusso N., Antiñolo G., Elías C., López J.J., López Márquez M.R., Riazzo C., Luque R.S., Almela A.F.D.S., Milena A.P., Smani Y., de la Torre Cisneros J., Butrón E.T., Moreno J.V., LISMOAN team. Listeriosis outbreak caused by contaminated stuffed pork, Andalusia, Spain, July to October 2019. Euro Surveill. 2022;27(43):pii=2200279.
PUBMED DOILifting COVID-19 mitigation measures in Spain (May-June 2020)
Monge S., Latasa Zamalloa P., Sierra Moros M.J., Pérez Olaso O., García San Miguel L., Varela C., Rivera Ariza S., Vázquez Torres M.C., Olmedo Lucerón M.D.C., González Yuste P., Soler Crespo P., Segura del Pozo J., Gullón P., Carrasco J.M., Martínez Sánchez E.V., Redondo Bravo L., Pichiule Castañeda M., Purriños Hermida M.J., Hervada Vidal X., Huerta Gonzalez I., Margolles M., Vanaclocha Luna H., Ramalle Gómara E., Pérez Martín J.J., Chirlaque López M.D., López Fernández M.J., Lorusso N., Carmona Ubago A., Rivas Perez A., Ramos Marin V., Criado Alvarez J.J., Castrillejo Pérez D., Góméz Anés A.A., Frontera M., Macias Rodriguez P., Álvarez León E.E., Díaz Casañas M., Lopaz Perez M.A., Alonso Pérez de Ágreda J.P., Navas Gutierrez P., Rosell Aguilar I., Arteagoitia Axpe J.M., Gonzalez Carril F., Aparicio Azcárraga P., Simón Soria F., Suarez Rodríguez B., Members of the Technical advisory group for the lifting of lockdown measures. Lifting COVID-19 mitigation measures in Spain (May–June 2020) [La desescalada de las medidas de mitigación contra el COVID-19 en España (mayo–junio 2020)] Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica 41 (2023) 11–17
PUBMEDModeling the regional distribution of international travelers in Spain to estimate imported cases of dengue and malaria: statistical inference and validation study.
García-García D, Fernández-Martínez B, Bartumeus F, et al. JMIR Public Health Surveill. 2024;10:e51191.
PUBMEDThe impact of meteorological factors on tuberculosis incidence in Spain: a spatiotemporal analysis.
Díez Galán MDM, Redondo-Bravo L, Gómez-Barroso D, et al. Epidemiol Infect. 2024 Mar 20;152:e58.
PUBMEDModelling the spatial risk of malaria through probability distribution of Anopheles maculipennis s.l. and imported cases.
Taheri S, González MA, Ruiz-López MJ, et al. Emerging Microbes & Infections. 2024 13:1, 2343911.
PUBMEDSpatial analysis for risk assessment of dengue in Spain.
Fernández-Martínez B, Pampaka D, Suárez-Sánchez P, et al. Enferm Infecc Microbiol Clin (Engl Ed) . 2023 Nov 7:S2529-993X(23)00257-5.
PUBMEDA systematic review of environmental factors related to WNV circulation in European and Mediterranean countries.
Giesen C, Herrador Z, Fernandez-Martinez B, et al. One Health . 2023 Jan 6:16:100478.
PUBMEDDetection of dengue in German tourists returning from Ibiza, Spain, related to an autochthonous outbreak, August to October 2022.
García-San-Miguel L, Giménez-Durán J, Saravia-Campelli G, et al. Euro Surveill. 2024;29(14):pii=2300296.
PUBMEDToxoplasma gondii exposure in wildlife in Spain: Is there any predictable threat for humans and domestic animals?
González-Barrio D, Carpio AJ, Preite L, Miguel-Vicedo M, Estévez-Reboredo RM, González-Viadero M, Barba-Sánchez R, Calero-Bernal R, Carmena D, Fuentes I. Sci Total Environ. 2024 Jul 20;935:173290. doi: 10.1016/j.scitotenv.2024.173290. Epub 2024 May 21. PMID: 38782291.
PUBMEDUnprecedented increase of West Nile virus neuroinvasive disease, Spain, summer 2020.
García San Miguel L, Fernández-Martínez B, Sierra Moros MJ, Vázquez A, Julián Pachés P, García Villacieros E, Gómez Martín MB, Figuerola Borras J, Lorusso N, Ramos Aceitero JM, Moro E, de Celis A, Oyonarte S, Mahillo B, Romero González LJ, Sánchez-Seco MP, Suárez Rodríguez B, Ameyugo Catalán U, Ruiz Contreras S, Pérez-Olmeda M, Simón Soria F. Euro Surveill. 2021;26(19):pii=2002010. doi.org/10.2807/1560-7917.
PUBMEDScabies in Spain? A comprehensive epidemiological picture
Redondo-Bravo L, Fernandez-Martinez B, Gómez-Barroso D, Gherasim A, García-Gómez M, Benito A, Herrador Z. PLoS One. 2021 Nov 1;16(11):e0258780. doi: 10.1371/journal.pone.0258780. eCollection 2021. PMID: 34723979 Free PMC article.
PUBMEDMarked increase in cryptosporidiosis cases, Spain, 2023. Euro Surveill. 2024;29(28):2300733.
Peñuelas Martínez M, Carmena D, Guzmán Herrador BR, et al.
DOIIncreasing trends in hepatitis E hospitalisations in Spain, 1997 to 2019. Euro Surveill. 2024;29(43):pii=2400118.
Guerrero-Vadillo María, Peñuelas Marina, Carmona Rocío, León-Gómez Inmaculada, Varela Carmen.
DOIBrotes de transmisión alimentaria e hídrica en España, 2018-2022. BES [Internet]. 29 de julio de 2024 [citado 31 de octubre de 2024];32(2):61-73.
Sanz-Olea E, Peñuelas M, Guerrero-Vadillo M, Sastre-García M, Díaz O, Cano-Portero R, et al.
DOISituación epidemiológica de la hepatitis A en España. Años 2021 y 2022
Guerrero-Vadillo M, Peñuelas M, Varela C. Situación epidemiológica de la hepatitis A en España. Años 2021 y 2022. BES [Internet]. 22 de diciembre de 2023;31(4):243-52. Disponible en: //revista.isciii.es/index.php/bes/article/view/1339
Estimated Impact of Nirsevimab on the Incidence of Respiratory Syncytial Virus Infections Requiring Hospital Admission in Children < 1 Year, Weeks 40, 2023, to 8, 2024, Spain.
Mazagatos C, Mendioroz J, Rumayor MB, Gallardo García V, Álvarez Río V, Cebollada Gracia AD, et al. Influenza Other Respir Viruses. 2024 May;18(5):e13294.
PUBMED DOILife expectancy of people with HIV on antiretroviral therapy in Spain
Jarrín I, Rava M, Del Romero Raposo J, Rivero A, Del Romero Guerrero J, De Lagarde M, Martínez Sanz J, Navarro G, Dalmau D, Blanco JR, Koerting A, Gomez Castell J, Del Amo J; CoRIS. AIDS. 2024 Mar 1;38(3):387-395.
PUBMEDSharp increase in gonorrhoea notifications among young people, EU/EEA, July 2022 to June 2023.
Nerlander L, Champezou L, Gomes Dias J, Aspelund G, Berlot L, Constantinou E, Díaz A, Epštein J, Fogarassy E, Hernando V, Hoffmann P, Igoe D, Klavs I, Pinto Leite P, Liitsola K, McIntyre A, Molnár Z, Olsen Anne O, Pires-Afonso Y, Putniņa R, Rudaitis K, Siakallis G, de Stoppelaar S, Suligoi B, Hannila-Handelberg T, Velicko I, Cabral Veríssimo V, Visser M, Wessman M, Mårdh O. Euro Surveill. 2024; 29(10):pii=2400113.
PUBMED DOIInformación adicional
Los objetivos principales de esta subunidad son:
- Prestar apoyo en diseño y gestión de bases de datos y aplicaciones para dispositivos móviles/aplicaciones web
- Mantener los servidores de información de enfermedades crónicas y de mortalidad con los que cuenta el CNE (Servidor de Información Epidemiológica on-line “ARIADNA” (https://ariadna.isciii.es/), Servidor de Información Epidemiológica on-line “RAZIEL” (https://raziel.isciii.es/).
- Dar soporte técnico y logístico a la investigación en enfermedades crónicas desde un punto de vista genético y bioinformático (Gestión y desarrollo de aplicaciones de anotación para marcadores genéticos (SNPs, MicroRNA, etc) y extracción de información de estos, Tools de recodificación de identificadores de marcadores y cruces de bases de datos genómicas y representación de datos genómicos).
- Investigar y desarrollar métodos relacionados con instrumentos para la obtención de información y transmisión de esta en la investigación epidemiológica, la integración de fuentes de información y datos epidemiológicos y las infraestructuras de computación, almacenaje y transferencia de datos en salud.
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