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Investigación

Líneas de investigación

Contenidos con Investigacion Subunidad de Bioinformática y Gestión de Datos .

Subunidad de Bioinformática y Gestión de Datos

Esta subunidad (Bioinformática y Gestión de Datos (BIOGEDA), Bioinformatics and Data Management (BIODAMA)), integrada en la Unidad de Epidemiología del Cáncer y Ambiental, tiene como principales líneas de investigación:

  • Diseño y desarrollo de instrumentos para la obtención de información y transmisión de la misma en la investigación epidemiológica.
  • Integración de fuentes de información y datos epidemiológicos
  • Bioinformática en el contexto de la epidemiología molecular/genética.
  • Infraestructuras de computación, almacenaje y transferencia de datos en salud.

Publicaciones destacadas

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Epidemiología y carga de enfermedad por VRS en España. SiVIRA, temporadas 2021-22 y 2022-23.

Puma Olguin TC, Mazagatos C, Galindo-Carretero S, Vega-Piris L, Lozano-Álvarez M, Pérez-Gimeno G, et al. BES. 2024 May 6; 32(1):21-35.

DOI

Effectiveness and tolerability of dolutegravir/lamivudine for the treatment of HIV-1 infection in clinical practice.

Suárez-García I, Alejos B, Hernando V, Viñuela L, Vera García M, Rial-Crestelo D, Pérez Elías MJ, Albendín Iglesias H, Peraire J, Tiraboschi J, Díaz A, Moreno S, Jarrín I; Cohort of the Spanish HIV/AIDS Research Network (CoRIS). J Antimicrob Chemother . 2023 Jun 1;78(6):1423-1432. doi: 10.1093/jac/dkad102.

PUBMED

Enfermedad Neumocócica Invasiva en España en 2023.

Soler Soneira M, Del-Águila-Mejía J, Acosta-Gutiérrez M, Sastre-García M, Amillategui- Dos-Santos R, Cano Portero R. BES [Internet]. 29 de julio de 2024 [citado 28 de agosto de 2024];32(2):74-93.

DOI

Effectiveness of MVA-BN vaccination in a population at high-risk of mpox: a Spanish cohort study.

Fontán-Vela M, Hernando V, Olmedo C, Coma E, Martínez M, Moreno-Perez D, Lorusso N, Vázquez Torres M, Barbas Del Buey JF, Roig-Sena J, Pastor E, Galmés Truyols A, Artigues Serra F, Sancho Martínez RM, Latasa Zamalloa P, Pérez Martínez O, Vázquez Estepa A, García Rojas AJ, Barreno Estévez AI, Sánchez-Migallón Naranjo A, Pérez Martín JJ, Peces Jiménez P, Morales Romero R, Castilla J, García Cenoz M, Huerta Huerta M, Lieve Dirk Boone A, Macías Ortiz MJ, Álvarez Río V, Rodríguez Recio MJ, Merino Díaz M, Berradre Sáenz B, Villegas-Moreno MT, Limia A, Diaz A, Monge S; Spanish MPOX vaccine effectiveness study group. Clin Infect Dis. 2024; 78(2):476-483.

PUBMED DOI

Exploring the effect of clinical case definitions on influenza vaccine effectiveness estimation at primary care level: Results from the end-of-season 2022-23 VEBIS multicentre study in Europe.

Maurel M, Mazagatos C, Goerlitz L, Oroszi B, Hooiveld M, Machado A, et al. Vaccine. 2024 Jun 11;42(16):3547–54.

PUBMED DOI

HIV medical care interruption among people living with HIV in Spain, 2004-2020.

Izquierdo R, Rava M, Moreno-García E, Blanco JR, Asensi V, Cervero M, Curran A, Rubio R, Iribarren JA, Jarrín I; Cohort of the Spanish HIV/AIDS Research Network (CoRIS). AIDS . 2023 Jul 1;37(8):1277-1284. doi: 10.1097/QAD.0000000000003552. Epub 2023 Mar 21.

PUBMED

Reduced pertussis disease severity in infants following the introduction of pertussis vaccination of pregnant women in Spain, 2015-2019.

Parisi A, Nuñez O, López-Perea N, Masa-Calles J. Vaccine. 2024 Mar 25:S0264-410X(24)00315-3.

DOI

Quality, acceptability and usability of self-sampling kits used by non-healthcare professionals for STI diagnosis in Spain: a single-blind study.

Gómez-Castellá J, Cobos Briz M, Nuño N, Diaz A, Bru-Gorraiz FJ, Martín-Gorgojo A, Almonacid-Garrido MC, Mir A, Muñoz M, del Amo J. et al. Sex Transm Infec. 2024. 0:1–6. doi:10.1136/sextrans-2024-056124.

PUBMED

Contenidos con Investigacion Subunidad de Bioinformática y Gestión de Datos .

Listado de personal

Información adicional

Los objetivos principales de esta subunidad son:

  • Prestar apoyo en diseño y gestión de bases de datos y aplicaciones para dispositivos móviles/aplicaciones web
  • Mantener los servidores de información de enfermedades crónicas y de mortalidad con los que cuenta el CNE (Servidor de Información Epidemiológica on-line “ARIADNA” (https://ariadna.isciii.es/), Servidor de Información Epidemiológica on-line “RAZIEL” (https://raziel.isciii.es/).
  • Dar soporte técnico y logístico a la investigación en enfermedades crónicas desde un punto de vista genético y bioinformático (Gestión y desarrollo de aplicaciones de anotación para marcadores genéticos (SNPs, MicroRNA, etc) y extracción de información de estos, Tools de recodificación de identificadores de marcadores y cruces de bases de datos genómicas y representación de datos genómicos).
  • Investigar y desarrollar métodos relacionados con instrumentos para la obtención de información y transmisión de esta en la investigación epidemiológica, la integración de fuentes de información y datos epidemiológicos y las infraestructuras de computación, almacenaje y transferencia de datos en salud.

Contacto
Tel.: +34 91 822 26 44
Email: pfernandezn@isciii.es

 

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