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Subunidad de Bioinformática y Gestión de Datos
Esta subunidad (Bioinformática y Gestión de Datos (BIOGEDA), Bioinformatics and Data Management (BIODAMA)), integrada en la Unidad de Epidemiología del Cáncer y Ambiental, tiene como principales líneas de investigación:
- Diseño y desarrollo de instrumentos para la obtención de información y transmisión de la misma en la investigación epidemiológica.
- Integración de fuentes de información y datos epidemiológicos
- Bioinformática en el contexto de la epidemiología molecular/genética.
- Infraestructuras de computación, almacenaje y transferencia de datos en salud.
Publicaciones destacadas
First cross-border outbreak of foodborne botulism in the European Union associated with the consumption of commercial dried roach (Rutilus rutilus)
Hendrickx D, Varela Martínez C, Contzen M, Wagner-Wiening C, Janke K-H, Hernando Jiménez P, Massing S, Pichler J, Tichaczek-Dischinger P, Burckhardt F, Stark K, Katz K, Jurke A, Thole S, Carbó R, del Pobil Ferré MP, Nieto M, Zamora MJ, Sisó A, Pallares García P, Valdezate S, Schaade L, Worbs S, Dorner BG, Frank C and Dorner MB. First cross-border outbreak of foodborne botulism in the European Union associated with the consumption of commercial dried roach (Rutilus rutilus). Front. Public Health 2023;10:1039770.
PUBMED DOICaracterísticas epidemiológicas de los brotes de hepatitis A en España (años 2015-2019)
Guerrero-Vadillo M, Peñuelas Martínez M, Varela Martínez C. Características epidemiológicas de los brotes de hepatitis A en España (años 2015-2019). BES [Internet]. 24 de enero de 2022 ;29(2). Disponible en: //revista.isciii.es/index.php/bes/article/view/1124
Severity of the clinical presentation of hepatitis A in five European countries from 1995 to 2014
Severi E, Georgalis L, Pijnacker R, Veneti L, Turiac IA, Chiesa F, Rizzo C, Martinelli D, Vold L, Herrador BG, Martinez CV, Sanchez EVM, Semenza JC, Lopalco P, Dahlström LA, Giesecke J. Severity of the clinical presentation of hepatitis A in five European countries from 1995 to 2014. International Journal of Infectious Diseases 2022; 118, 34-43
PUBMED DOIInvestigation of an international outbreak of multidrug-resistant monophasic Salmonella Typhimurium associated with chocolate products, EU/EEA and United Kingdom, February to April 2022
Larkin L., de la Gandara M.P., Hoban A., Pulford C., Silva N.J.-D., de Valk H., Browning L., Falkenhorst G., Simon S., Lachmann R., Dryselius R., Karamehmedovic N., Börjesson S., van Cauteren D., Laisnez V., Mattheus W., Pijnacker R., van den Beld M., Mossong J., Ragimbeau C., Vergison A., Brandal L.T., Lange H., Garvey P., Nielsen C.S., León S.H., Varela C., Chattaway M., Weill F.-X., Brown D., McKeown P. Investigation of an international outbreak of multidrug-resistant monophasic Salmonella Typhimurium associated with chocolate products, EU/EEA and United Kingdom, February to April 2022. Euro Surveill2022;27(15):pii=2200314.
PUBMED DOIBotulism in Spain: Epidemiology and Outcomes of Antitoxin Treatment, 1997-2019
Peñuelas M, Guerrero-Vadillo M, Valdezate S, Zamora MJ, Leon-Gomez I, Flores-Cuéllar Á, Carrasco G, Díaz-García O, Varela C. Botulism in Spain: Epidemiology and Outcomes of Antitoxin Treatment, 1997-2019. Toxins (Basel). 2022 Dec 20;15(1):2.
PUBMED DOIPrevicet Working Group On Viral Hepatitis. Hepatitis A Outbreak Characteristics: A Comparison of Regions with Different Vaccination Strategies, Spain 2010-2018
Domínguez A, Varela C, Soldevila N, Izquierdo C, Guerrero M, Peñuelas M, Martínez A, Godoy P, Borràs E, Rius C, Torner N, Avellón AM, Castilla J, Previcet Working Group On Viral Hepatitis. Hepatitis A Outbreak Characteristics: A Comparison of Regions with Different Vaccination Strategies, Spain 2010-2018. Vaccines (Basel). 2021 Oct 20;9(11):1214.
PUBMED DOIStatement of Peer Review
Bygvraa, D.A.; Crespi, S.; Cornejo, M.D.; De Marez, L.; Hadjichristodoulou, C.; Harth, V.; Jelicic, P.; Klein, J.; Michaelakis, A.;Mouchtouri, V.; et al. Statement of Peer Review. Med. Sci. Forum 2023;13, 34.
DOIEvaluación de la sensibilidad del sistema de vigilancia del botulismo en España entre 1997 y 2019
Peñuelas M, Guerrero-Vadillo M, Díaz-García O, García-García D, Varela C. Evaluación de la sensibilidad del sistema de vigilancia del botulismo en España entre 1997 y 2019. BES [Internet]. 31 de marzo de 2023;31(1):37-43. Disponible en: //revista.isciii.es/index.php/bes/article/view/1285
Información adicional
Los objetivos principales de esta subunidad son:
- Prestar apoyo en diseño y gestión de bases de datos y aplicaciones para dispositivos móviles/aplicaciones web
- Mantener los servidores de información de enfermedades crónicas y de mortalidad con los que cuenta el CNE (Servidor de Información Epidemiológica on-line “ARIADNA” (https://ariadna.isciii.es/), Servidor de Información Epidemiológica on-line “RAZIEL” (https://raziel.isciii.es/).
- Dar soporte técnico y logístico a la investigación en enfermedades crónicas desde un punto de vista genético y bioinformático (Gestión y desarrollo de aplicaciones de anotación para marcadores genéticos (SNPs, MicroRNA, etc) y extracción de información de estos, Tools de recodificación de identificadores de marcadores y cruces de bases de datos genómicas y representación de datos genómicos).
- Investigar y desarrollar métodos relacionados con instrumentos para la obtención de información y transmisión de esta en la investigación epidemiológica, la integración de fuentes de información y datos epidemiológicos y las infraestructuras de computación, almacenaje y transferencia de datos en salud.
Contacto
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