Subunidad de Bioinformática y Gestión de Datos
Líneas de investigación
Enfermedades de transmisión respiratoria
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Enfermedades transmitidas por agua y alimentos, vigilancia epidemiológica, prevención y control
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Envejecimiento, Neurodegeneración y Salud Mental
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Envejecimiento, Neurodegeneración y Salud Mental
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Epidemiología de Enfermedades Cardiovasculares y Metabólicas
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Epidemiología del Cáncer y Ambiental
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Subunidad de Bioinformática y Gestión de Datos
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Unidad de la Cohorte de la Red de Investigación en Sida (CoRIS)
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Vigilancia e Investigación del VIH e ITS
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IRAS – Infecciones Relacionadas con la Asistencia Sanitaria y Resistencias frente a Antimicrobianos
- Investigación en la epidemiología de las Infecciones Relacionadas con la Asistencia Sanitaria (IRAS). Valorar la calidad asistencial en cirugías frecuentemente realizadas en España usando como indicador la incidencia de IRAS.
- Variación geográfica de la carga de enfermedad por IRAS en hospitales.
- Estimación del impacto de la organización hospitalaria en la incidencia de IRAS.
- Investigación en la epidemiología de las Resistencias a Antimicrobianos (RAM).
- Valoración de la idoneidad de los tratamientos antimicrobianos en pacientes mayores con patologías crónicas de base.
- Estimación de costes asociados al manejo de las infecciones de microrganismos resistentes.
- Generación de modelos de predicción de riesgo de infección y de riesgo de infección por microorganismo resistentes.
Análisis espacial e impacto ambiental en enfermedades transmisibles
- Análisis espacio temporal de enfermedades transmisibles
- Análisis del impacto ambiental en la transmisión y difusión de enfermedades infecciosas
- Mortalidad diaria, factores meteorológicos y cambio climático
Enfermedades Prevenibles por Vacunación
- Vigilancia en la fase avanzada de erradicación de la poliomielitis. Vigilancia de la Parálisis Flácida Aguda.
- Vigilancia y epidemiología del sarampión y rubeola en fase de post-eliminación en España. Evaluación de nuevas herramientas en la vigilancia genómica del sarampión.
- Vigilancia epidemiológica y virológica de la parotiditis en España: patrones de circulación del virus de la parotiditis en el contexto de brotes epidémicos.
- Estudio de la reemergencia de tosferina en España después de la pandemia por COVID-19. Impacto de la vacunación de las gestantes en la gravedad de la tosferina en lactantes.
- Variaciones en la epidemiología de la varicela y del herpes zóster tras la inclusión de la vacunación en el calendario.
- Análisis de la evolución de los serotipos que causan la enfermedad neumocócica invasiva (ENI) en la actualidad, para adaptar las estrategias de prevención y control de la enfermedad
- Análisis comparativo de las tasas de incidencia de enfermedad meningocócica invasiva en las distintas Comunidades Autónomas. Evaluación del sistema de vigilancia de la enfermedad meningocócica invasiva.
- Vigilancia de los casos de enfermedad invasiva por Haemophilus influenzae tipo b (Hib) tras el cambio de pauta de vacunación en el programa de vacunación aprobado por el Sistema Interterritorial del Sistema Nacional de Salud en 2017. Análisis del incremento de casos de Hi capsulares (distintos a Hib) y no capsulares de los últimos años
Zoonosis, tuberculosis, emergentes y transmitidas por vectores
- Aplicar el enfoque de Una Salud
- Contribuir a la mejora del nivel de salud de la población mediante el estudio epidemiológico de las enfermedades transmitidas por vectores, las zoonosis y la tuberculosis a través del estudio epidemiológico de las mismas desde un enfoque de Una Salud.
- Estimación de riesgos
- Identificar factores y grupos de riesgo a través de la monitorización de la evolución temporo-espacial y distribución según otras variables ambientales y epidemiológicas de las enfermedades transmitidas por vectores, zoonosis y tuberculosis.
- Análisis del impacto de nuevas estrategias de prevención y control en las enfermedades transmitidas por vectores, las zoonosis y la tuberculosis
Publicaciones destacadas
Comparative severity of COVID-19 cases caused by Alpha, Delta or Omicron SARS-CoV-2 variants and its association with vaccination.
Varea-Jiménez E, Aznar Cano E, Vega-Piris L, Martínez Sánchez EV, Mazagatos C, García San Miguel Rodríguez-Alarcón L, et al. Enfermedades Infecc Microbiol Clin Engl Ed. 2024 Apr;42(4):187–94.
PUBMED DOIUnplanned pregnancies and social and partner support during pregnancy in Spanish women living with HIV.
Ruiz-Algueró M, Izquierdo R, Suárez-García I, Moreno C, Alejos B, Rava M, Moreno S, Montero Alonso M, Gutiérrez F, Gutierrez Cuellar I, Curran A, Hernando V, Jarrín I; Cohort of the Spanish HIV/AIDS Research Network (CoRIS). HIV Med . 2023 Jun;24(6):727-737. doi: 10.1111/hiv.13469. Epub 2023 Feb 21.
PUBMEDInvestigating Local Patterns of Mumps Virus Circulation, Using a Combination of Molecular Tools.
Gavilán AM, Perán-Ramos P, Sanz JC, García-Comas L, Pérez-Abeledo M, Castellanos AM, Berciano JM, López-Perea N, Masa-Calles J, Echevarría JE, Fernández-García A. Viruses. 2023 Dec 13;15(12):2420.
DOIEuropean HIV continuum of care working group. The HIV continuum of care in European Union countries in 2013: data and challenges
Gourlay A, Noori T, Pharris A, Axelsson M, Costagliola D, Cowan S, Croxford S, d'Arminio Monforte A, Del Amo J, Delpech V, Díaz A, Girardi E, Gunsenheimer-Bartmeyer B, Hernando V, Jose S, Leierer G, Nikolopoulos G, Obel N, Op de Coul E, Paraskeva D, Reiss P, Sabin C, Sasse A, Schmid D, Sonnerborg A, Spina A, Suligoi B, Supervie V, Touloumi G, Van Beckhoven D, van Sighem A, Vourli G, Zangerle R, Porter K; European HIV continuum of care working group. The HIV continuum of care in European Union countries in 2013: data and challenges. Clin Infect Dis. 2017; 64(12)1644-56
PUBMED DOIEffectiveness of XBB.1.5 Monovalent COVID-19 Vaccines During a Period of XBB.1.5 Dominance in EU/EEA Countries, October to November 2023: A VEBIS-EHR Network Study.
Monge S, Humphreys J, Nicolay N, Braeye T, Van Evercooren I, Holm Hansen C, et al. Influenza Other Respir Viruses. 2024 Apr;18(4):e13292.
PUBMED DOIPrevalence and factors associated with SARS-CoV-2 seropositivity in the Spanish HIV Research Network Cohort.
Berenguer J, Díez C, Martín-Vicente M, Micán R, Pérez-Elías MJ, García-Fraile LJ, Vidal F, Suárez-García I, Podzamczer D, Del Romero J, Pulido F, Iribarren JA, Gutiérrez F, Poveda E, Galera C, Izquierdo R, Asensi V, Portilla J, López JC, Arribas JR, Moreno S, González-García J, Resino S, Jarrín I. Clin Microbiol Infect. 2021 Nov;27(11):1678-1684
PUBMEDEnfermedad invasiva por Haemophilus influenzae. España 2021-2022.
Soler Soneira M, Granero Melcón B, Arroyo Nebreda V, Sastre García M, Amillategui Dos-Santos R, Cano Portero R. BES [Internet]. 29 de septiembre de 2023;31(3):201-14.
DOIGonorrhoea diagnoses in a network of STI clinics in Spain during the period 2006-2010: differences by sex and transmission route
Diaz A, Garriga C, Varela JA, Fernández E, Sanz I, Boronat J, Gual F, Colomo C, López de Munain J, Esteban V, Junquera ML, Martínez B, Pueyo I, Suárez J, Barberá MJ, Arando M, Ureña JM, Diez M; STI Study Group. Gonorrhoea diagnoses in a network of STI clinics in Spain during the period 2006-2010: differences by sex and transmission route. BMC Public Health. 2013;13:1093
PUBMED DOI-
Fernando García López
Jefe de Área
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Carmen Varela
Científico titular OPIs
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María Guerrero
Técnico superior facultativo y especialista
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Maria João Forjaz
Investigadora científica
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Marina Peñuelas
Técnico superior facultativo y especialista
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Javier Damián Moreno
Científico titular
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Celia Talaván González
Titulada Superior (Ing. Biomédica)
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Lorena Simón Méndez
Técnico especializado
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Teresa López Cuadrado
Técnico superior especialista
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Javier Almazán Isla
Técnico superior especialista
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María Carmen Rodríguez Blázquez
Técnico especializado
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Susana Villarrubia Enseñat
Jefa de Sección
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Elena Varea
Contrato Garantía de Empleo Juvenil
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Maria de Viarce Torres de Mier
Jefe de Servicio
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Maria Tellez-Plaza
Científico titular
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Marta Rava
Investigador doctor
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Rebeca Ramis Prieto
Científica Titular
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Marina Pollán Santamaría
Directora CNE, Jefa de Unidad, prof. investigación
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Beatriz Pérez-Gomez
Jefa de Unidad, Investigadora científica
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Roberto Pastor-Barriuso
Científico Titular
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List of staff
Información adicional
Los objetivos principales de esta subunidad son:a) prestar apoyo en diseño y gestión de bases de datos y aplicaciones para dispositivos móviles/aplicaciones webb) mantener los servidores de información de enfermedades crónicas y de mortalidad con los que cuenta el CNE (Servidor de Información Epidemiológica on-line “ARIADNA” (http://ariadna.cne.isciii.es), Servidor de Información Epidemiológica on-line “RAZIEL” (http://raziel.cne.isciii.es/).c) dar soporte técnico y logístico a la investigación en enfermedades crónicas desde un punto de vista genético y bioinformático (Gestión y desarrollo de aplicaciones de anotación para marcadores genéticos (SNPs, MicroRNA, etc) y extracción de información de estos, Tools de recodificación de identificadores de marcadores y cruces de bases de datos genómicas y representación de datos genómicos).d) investigar y desarrollar métodos relacionados con instrumentos para la obtención de información y transmisión de esta en la investigación epidemiológica, la integración de fuentes de información y datos epidemiológicos y las infraestructuras de computación, almacenaje y transferencia de datos en salud.
1. Tavoschi L, Gomes Dias J, Pharris A; EU/EEA HIV Surveillance Network. New HIV diagnoses among adults aged 50 years or older in 31 European countries, 2004-15: an analysis of surveillance data. Lancet HIV. 2017. pii: S2352-3018(17)30155-8. doi: 10.1016/S2352-3018(17)30155-8
2. AIDS Study Group (GESIDA), National AIDS Plan, STI Study group of the SEIMC (GEITS), Spanish Group for the Investigation of Sexual Transmission Diseases of the Spanish Academy of Dermatology and Venerology, The Spanish Society for Pediatric Infectious (SEIP). Consensus statement. Consensus document on the diagnosis and treatment of sexually transmitted diseases in adults, children and adolescents. Enferm Infecc Microbiol Clin. 2017. http://dx.doi.org/10.1016/j.eimc.2017.06.004
3. Álvaro-Meca A, Berenguer J, Díaz A, Micheloud D, Aldamiz-Echevarria T, Fanciulli C, et al. Stroke in HIV-infected individuals with and without HCV coinfection in Spain in the combination antiretroviral therapy era. PLoS One. 2017; 12(6):e0179493. http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0179493
4. Gourlay A, Noori T, Pharris A, Axelsson M, Costagliola D, Cowan S, Croxford S, d'Arminio Monforte A, Del Amo J, Delpech V, Díaz A, Girardi E, Gunsenheimer-Bartmeyer B, Hernando V, Jose S, Leierer G, Nikolopoulos G, Obel N, Op de Coul E, Paraskeva D, Reiss P, Sabin C, Sasse A, Schmid D, Sonnerborg A, Spina A, Suligoi B, Supervie V, Touloumi G, Van Beckhoven D, van Sighem A, Vourli G, Zangerle R, Porter K; European HIV continuum of care working group. The HIV continuum of care in European Union countries in 2013: data and challenges. Clin Infect Dis. 2017; 64(12):1644-56. https://doi.org/10.1093/cid/cix212
5. Álvaro-Meca A, Díaz A, de Miguel Díez J, Resino R, Resino S. Environmental Factors Related to Pulmonary Tuberculosis in HIV-Infected Patients in the Combined Antiretroviral Therapy (cART) Era. PLoS One. 2016; 11(11):e0165944. http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0165944
6. Álvaro-Meca A, Palomares-Sancho I, Diaz A, Resino R, Gil De Miguel A, Resino S. Pneumocystis pneumonia in HIV-positive patients in Spain: epidemiology and environmental risk factors. J Int AIDS Soc. 2015; 18:19906. http://dx.doi.org/10.7448/IAS.18.1.19906
7. Álvaro-Meca A, Rodríguez-Gijón L, Díaz A, Gil A, Resino S. Trend in nontuberculous mycobacterial disease in hospitalized subjects from Spain (1997-2010) according to HIV infection. HIV Med. 2015; 16(8):485-93.
8. Diaz A, del Romero J, Rodriguez C, Alastrue I, Belda J, Bru FJ, Cámara MM, Junquera ML, Sanz I, Viloria LJ, Gil L, Martínez E, Gual F, Landa MC, Pueyo I, Ureña JM, Martínez B, Varela JA, Polo A, Azpiri MA, Diez M, for the EPI-VIH Study Group. Effects of region of birth, educational level and age on late presentation among men who have sex with men newly diagnosed with HIV in a network of STI/HIV counselling and testing clinics in Spain. Euro Surveill. 2015;20(14):pii=21088.
http://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES2015.20.14.21088
9. Belza MJ, Hoyos J, Fernández-Balbuena S, Diaz A, Bravo MJ, de la Fuente L, the Madrid HIV rapid testing group. Assessment of an outreach street-based HIV rapid testing programme as a strategy to promote early diagnosis: a comparison with two surveillance systems in Spain, 2008–2011. Euro Surveill. 2015;20(14):pii=21089. http://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES2015.20.14.21089
Aplicaciones para dispositivos móviles
AMICAES es una aplicación gratuita desarrollada por la Subunidad de Bioinformática y Gestión de Datos (BIODAMA) del Centro Nacional de Epidemiología que permite visualizar en mapas de colores la mortalidad municipal por cáncer en España.
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Atlas de mortalidad por cáncer
Atlas de mortalidad por cáncer en Portugal y España 2003-2012 (Clic en la imagen para descargarlo) |
Atlas municipal de mortalidad por cáncer en España 1989-1998 (Clic en la imagen para descargarlo) |
Atlas de mortalidad por Cáncer y Otras Causas en España 1978-1992 (Clic en la imagen para descargarlo) |
Epidemiología del Cáncer y Ambiental
a) Vigilancia epidemiológica
- Monitorización de la situación del cáncer en España:
- Estudio de la mortalidad, incidencia, prevalencia y supervivencia de los principales tumores malignos, entrando sin reservas en el difícil terreno de la interpretación de los diferentes indicadores
- Monografías periódicas actualizando la información disponible sobre cáncer, mediante la elaboración de material original, especialmente en el análisis de la mortalidad, y la recopilación de los últimos datos disponibles para los indicadores proporcionados pos otras instituciones.
- Análisis en profundidad de la evolución temporo-espacial de la distribución de tumores específicos.
- Servidores interactivos de información epidemiológica (administrado por la Subunidad de Bioinformática y Gestión de Datos).
- Atlas municipal de mortalidad por cáncer y otras causas en España. 1989-1998. (339MB): Muestra la distribución municipal de la mortalidad por cáncer y algunas otras causas de muerte en España. Contiene mapas de alta calidad en color, con comentarios generales sobre la distribución geográfica observada y las características concretas del tumor analizado. Incluye también mapas con el patrón geográfico de determinadas variables socio-económicas y de industrias contaminantes declaradas al Registro Estatal de Emisiones y Fuentes Contaminantes (EPER-España).
- Mortalidad por Cáncer en España (2015)
- Años anteriores: 2014 - 2013 - 2012 - 2011 - 2010 - 2009 - 2008 - 2007 - 2006 - 2005 - 2004 - 2003 - 2002 - 2001 - 2000 - 1999 - 1998 -1997 - 1996 - 1995 - 1994 - 1993 - 1992
- Mortalidad por provincias. Año 2000 - Año 1996
- La situación del cáncer en España: Informe 2015
b) Estudios epidemiológicos comisionados
- Coordinación y ejecución de estudios epidemiológicos comisionados por administraciones públicas para evaluar alertas o riesgos para la salud relacionados con cáncer y exposiciones ambientales
c) Representación institucional
- Comité de Seguimiento y Evaluación de la Estrategia en Cáncer del SNS. Ministerio de Sanidad, Servicios Sociales e Igualdad. Representante del ISCIII
- Representación del ISCIII en la Agencia Internacional de Investigación en Cáncer (IARC)
d) Comités y grupos de trabajo externos
- Comités Científico Externos de Institutos de Investigación
- Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria
- Instituto de Investigación Sanitaria de Aragón
- External Scientific Council Vall d'Hebron Institute of Research
- Consejo Académico de la Escuela de Salud Pública de Menorca
- Consejo Técnico Asesor del Centro de Recursos de Evaluación de Impacto en Salud. Escuela Andaluza de Salud Pública. (crEIS)
- Consejo Asesor del Parque Científico de Madrid (PCM)
- Comité Técnico Nacional de la Asociación Española Contra el Cáncer
- Comité Técnico Regional de la Asociación Española Contra el Cáncer en Madrid
- Grupos de trabajo de la Sociedad Española de Epidemiología ( Cribado, Vigilancia)
e) Asesorías e informes técnicos
- Asesoría al Gobierno o al Parlamento para comparecencias parlamentarias o informes solicitados sobre el ámbito de trabajo de la Unidad. Respuesta a preguntas parlamentarias
- Participación como expertos en informes técnicos sobre temas específicos
f) Participación en Acciones Conjuntas
- Participación en la Joint Action on Health Information, financiada por la Unión Europea.
- Participación en la Human Biomonitoring Iniciative for EU (HBM4EU)
g) Participación en comités internos del ISCIII
- Grupo de Trabajo de Protección de Datos de la Subdirección General de Servicios Aplicados, Formación e Investigación (SGSAFI)
- Comité de Investigación del Instituto de Salud Carlos III
- Comité del Plan de Gestión Ambiental del ISCIII.
h) Formación
- Dirección de tesis doctorales y tesinas de grado y de fin de máster
- Tutoría de residentes de Medicina Preventiva y Salud Pública
- Tutorías de estudiantes de pregrado y becarios predoctorales
- Colaboración docente estable en la Universidad Autónoma de Madrid y en la Escuela Nacional de Sanidad.
- Actividades docentes en otras instituciones nacionales e internacionales y cursos de formación on-line sobre epidemiología de cáncer
- Actividades de difusión de la información.
➣ Informes Anuales de la Red Nacional de Vigilancia Epidemiológica (RENAVE)
La publicación del Informe Anual global se ha sustituido por la actualización del análisis epidemiológico para cada enfermedad o patógeno que se vigila en la Red Nacional de Vigilancia Epidemiológica en el apartado A-Z de esta web. El objetivo es disminuir el tiempo entre consolidación de la información y su publicación y tener mayor flexibilidad en el formato y extensión de cada informe.
➣ Informes Anuales del Sistema de Información Microbiológica (SIM)
Por la Orden SSI 445/2015 del Ministerio de Sanidad una parte de las enfermedades que se vigilaban de forma voluntaria por el SIM pasaron a ser de declaración obligatoria. Como consecuencia, se interrumpió la publicación de los Informes Anuales del Sistema de Información Microbiológica en 2017. La actualización de la información de los patógenos y enfermedades cuya vigilancia se mantiene se puede encontrar en el apartado A-Z de esta web.
Otros informes
Vacuna antigripal recomendada por la OMS para la temporada 2022-2023 en el hemisferio norte.
Efectividad de la vacuna antigripal. Resultados finales.(cycEva 2019-20)
La gripe en el contexto de COVID-19. Preguntas y respuestas
Efectividad de la vacuna antigripal. Resultados finales.(cycEva 2018-19)
Efectividad de la vacuna antigripal 2017-18 en España
Umbral basal y niveles de intensidad gripal. Temporada 2015-16
Preguntas y respuestas de los profesionales sanitarios sobre vacunación estacional. Diciembre 2011
Vigilancia de la gripe en el periodo estival 2010
Mantenimiento de la vigilancia de la gripe SVGE.2009
Evolución de la actividad gripal. Hemisferio sur. Mayo-septiembre 2009
Caso humano de infección por virus gripal AH1 de posible origen porcino. 2009
Evaluación riesgo ECDC caso humano de infección por virus gripal AH1. 2009
Evaluación redes centinela en España integradas en el SVGE.2007-08
Mortalidad de cáncer en España - Tabla de datos
DEPARTAMENTO DE ENFERMEDADES TRANSMISIBLES
Su misión es mejorar el conocimiento de las enfermedades transmisibles y de los brotes de cualquier etiología, mediante la vigilancia e investigación epidemiológica y de salud pública. El objetivo es proporcionar información de calidad para guiar el control y prevención de las enfermedades transmisibles, así como orientar el diseño, implementación y evaluación de políticas sanitarias.
Las funciones del Departamento son:
- 1. Prestación de servicios Científico-Técnicos de referencia que proporcionen apoyo al Sistema Nacional de salud.
- 2. Investigación en Salud Pública en el ámbito de competencia del Departamento.
- 3. Formación en Salud Pública de profesionales de ámbitos multidisciplinares.
El sistema de monitorización de la mortalidad diaria por todas las causas (MoMo) fue desarrollado en 2004, en el marco del «Plan de acciones preventivas contra los efectos de las temperaturas excesivas», coordinado por el Ministerio de Sanidad, para reducir el impacto sobre la salud de la población como consecuencia del exceso de temperatura. El objetivo de MoMo era identificar las desviaciones de mortalidad diaria observada con respecto a la esperada según las series históricas de mortalidad. Posteriormente se amplió su utilización a otras situaciones durante todo el año para estimar de forma indirecta el impacto de cualquier evento de importancia en salud pública. En el Panel MoMo se actualizan diariamente las estimaciones de excesos de mortalidad por todas las casusas y atribuibles a un exceso o defecto de la temperatura, por ámbito poblacional (nacional, de CCAA y provincial), sexo y grupo de edad (todas las edades, 0-14, 15-44, 45-64, 65-74, 75-84 y >85 años). Más detalles de su metodología aquí.
-
- • Información sobre la actualización de MoMo
- • Panel MoMo
- • Índice Kairós
- • Informes semanales
- • Informes de excesos de mortalidad en periodo estival e invernal (desde 2022)
- • Información de periodos estivales anteriores
- • Panel MoMo
Informe de Situación
El objetivo del Boletín Epidemiológico Semanal y del Boletín Semanal en Red es difundir información de calidad y útil procedente de las actividades de la Red Nacional de Vigilancia Epidemiológica a los profesionales de salud pública, distintas instituciones y público en general interesados en la información relativa a la vigilancia de enfermedades transmisibles.
Informes anteriores
Vigilancia Epidemiológica del VIH y el SIDA en España, 2022
Vigilancia Epidemiológica del VIH y el SIDA en España, 2021
Vigilancia epidemiológica del VIH y el SIDA en España, 2020
Vigilancia epidemiológica del VIH y el SIDA en España, 2019
Vigilancia epidemiológica del VIH y el SIDA en España, 2018
Vigilancia epidemiológica de VIH y el SIDA en España, 2017
Vigilancia epidemiológica de VIH y el SIDA en España, 2016
Vigilancia epidemiológica de VIH y el SIDA en España, 2015
Vigilancia epidemiológica de VIH y el SIDA en España, 2014
Informes anuales anteriores:
Además de los informes anuales de la vigilancia de la parálisis flácida aguda, para algunos de los años los resultados de la vigilancia también se publican en el boletín epidemiológico semanal:
Año 2015
Año 2014
Año 2013
Boletín epidemiológico semanal
Año 2012
Año 2011
Boletín epidemiológico semanal
Año 2010
Año 2009
Año 2008
Boletín epidemiológico semanal
Año 2007
Boletín epidemiológico semanal
Año 2006
Boletín epidemiológico semanal
Año 2005
Boletín epidemiológico semanal
Año 2004
Año 2002
Año 2001